公共仪器平台是上海脑中心下设的技术支撑平台，平台秉承“服务，创新，分享”的宗旨，为上海脑中心及上海及长三角地区脑科学研究网络单位提供仪器共享和技术服务。公共仪器平台目前配备了三维小动物成像、流式细胞仪、生物学X射线辐照仪、高温高压灭菌设备等大型仪器设备。
平台服务：
1、技术服务：平台负责提供流式细胞分析/分选技术、高温高压灭菌、三维小动物成像、辐照仪、蛋白质组学及代谢组学前处理、质谱分析以及数据分析等技术服务。
2、开放服务：平台负责仪器维护及日常管理，开放门禁、账号等权限由课题组自行操作，提供纯水、超纯水、制冰机、洗衣机、烘干机以及服务器存储系统等常规设备的使用服务。
3、仪器功能开发，新技术新方法的开发和推广服务。
单细胞测序平台致力于打造高质量的研发服务平台，为上海以及长三角地区承担国家重大科研任务的研究团队，提供优质高效的单细胞转录组与空间转录组技术相结合的多组学技术服务。
单细胞转录组与空间转录组技术相结合，可以在同一个样本中实现组织、细胞、亚细胞和分子四个尺度的综合分析。为深入研究细胞基因表达与其形态和局部环境之间的关系提供了基础。不仅能够揭示细胞的空间分布及细胞类型异质性，还可以探索细胞命运转变、分子变化的发育轨迹，并对基因和细胞的动态变化过程进行高精度解析。平台与华大智造合作成立了脑科学领域首个DCS LAB 多组学前沿实验室，已建立单细胞转录组、空间转录组以及单细胞联合空间转录组等全流程测序技术，能够为用户提供一站式全流程服务，涵盖实验方案设计、样本前处理、文库制备、质控分选、高通量测序及数据交付。平台已经在多物种样本中获得了稳定优质的数据结果。承担国家研究任务的团队可享有优先服务、优惠价格等，针对首次合作的团队或新物种、新组织样本，我们提供免费测试和样本前处理培训。
平台服务：
1、单细胞（核）悬液样本制备：具备在多物种（鼠、人、非人灵长类）多器官（脑、血管、血液)上丰富的制样经验。
2、样本质量检测：使用安捷伦4200生物分析仪检测评估真核生物样本RNA完整性，具有方便快捷，检测结果准确率高等特点。样本流式分选：使用BeckmanAstrios EQ流式分选仪开展单细胞分选富集。
3、单细胞（核）转录组液滴生成及文库制备：平台使用MGI-TAM4-V3.0单细胞平台，采用单细胞3' RNA-seq技术，基于磁珠引物尾部设计polyT碱基，捕获mRNA polyA特异性互补配对，并完成细胞的分离标记，制备多细胞混合的文库。平台具有在多物种（鼠、人、非人灵长类）多器官（脑、血管、血液）中丰富的单细胞转录组制样建库经验。
4、单细胞ATAC液滴生成及文库制备：使用MGI-TAM4-ATAC单细胞平台，单细胞核ATAC是基于转座酶的染色质可及性检测技术，利用转座酶可以随机转座到细胞核内染色质的开放区域，并加上接头、扩增建库，通过测序获得整个基因组内染色质开放区域的DNA序列，平台已具备在鼠和人样本脑组织上的单细胞核ATAC制样建库经验。
5、空间转录组新鲜样本制样及文库制备：使用空间转录组Stereo-V1.3技术，凭借其卓越的捕获性能，可通过快速简便的工作流程，可捕获到高水平基因数；该管线可灵活选择同片ssDNA或H&E染色，满足多样化的研究需求。
6、空间转录组石蜡样本制样及文库制备：针对福尔马林固定石蜡包埋（Formalin Fixed Paraffin Embedded，FFPE）样本，由于该类型样本存在较高mRNA降解可能性，平台使用的空间转录组Stereo-seq-FFPE技术，进行了针对性的优化并使用了随机探针方案来提高基因捕获效率，即使是RIN值较低的样本也可成功制样。由于随机探针不受Poly A的限制，使得该方法在原位捕获目标物种基因表达信息的同时，也能够实现编码及非编码RNA的共捕获，满足多种研究需求。
7、核酸片段质控：平台使用安捷伦5200生物分析仪检测评估cDNA片段分布，具有高效准确等特点。
8、高通量二代测序（MGI-T7测序平台）：平台配置的高通量二代基因测序仪系统可以同时对数百万甚至数十亿个DNA片段进行测序，在24小时内产出数据量可高达几Tb，可以广泛适用于全基因组测序；单细胞转录组、单细胞表观组及时空组学测序等测序项目。
联系我们
平台负责人：郑昌虹博士
邮箱：zhengchanghong@bsbii.cn
地址：松江区强业路555号1103-2室
光学成像展示平台旨在为上海及长三角地区脑科学研究网络的科研团队提供高质量的光学成像技术服务。平台秉承对外开放、合作共享的原则，打造专业化、国际化的服务平台，配备了激光共聚焦显微镜，双光子显微镜，研究级全玻片扫描系统，荧光显微镜/体视显微镜等显微成像设备。平台长期展示国内外业界显微成像公司前沿新款样机及最新成像技术，紧跟前沿成像领域，组织开展技术交流与研讨，探索新技术在脑科学及相关学科中的应用，不断培养提升平台技术支撑人才。
平台服务：
1、展示业界前沿新款样机及成像技术，促进技术交流与研讨
2、为用户提供成像方案咨询，指导选择合适的成像仪器
3、为用户提供仪器使用培训，协助参与相关课题及任务开展
4、为用户提供成像技术支持，标准操作流程与项目合作
成像设备：
1、Nikon AX R MP with NSPARC
2、Evident FVMPE-RS
3、Leica SP8 DIVE
4、Evident FV3000
5、Nikon A1
6、Evident Slideview VS200
7、Leica DMi8
8、Leica M205 FA
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平台负责人：谭莉老师
邮箱：tanli@bsbii.cn
地址：松江区强业路555号1111室
